在近55亿年历史中，地球已经历过5次物种大灭绝事件，分别是：奥陶纪大灭绝、泥盆纪大灭绝、二叠纪大灭绝、三叠纪-侏罗纪大灭绝、白垩纪-第三纪大灭绝。每次大灭绝都会造成整科、整目甚至整纲生物短时间内从地球上集群性消失。每次都会造成整科、整目甚至整纲生物短时间内从地球上集群性消失。而在工业革命之后，人类的科技文明进入了前所未有的高速发展阶段，与此同时，由于人类活动导致的植物生存环境破坏、自然资源过度开发以及污染和气候变化，物种正以比过去快千倍的速度灭绝，专家们预言称，人类正在迎来第六次物种大灭绝。
虽然人们已经逐渐意识到保护环境的重要性，但是科技文明发展的洪流滚滚向前，大势所趋，人类对能源的需求越来越大。尽管世界各国已经开始重视环保问题，颁布了一系列有关环保的法律法规，但是也只能是治标不治本，随着地球资源的不断减少，人类开始将目光看向了无尽的星空。
纵观历史，其实人类一直对太空深深着迷，从公元前700年巴比伦天文学家绘制行星轨迹，到古印加人和阿兹特克人建造的早期天文观象台，再到发射第一颗人造卫星斯普特尼克1号和人类登陆月球，以及如今，一些私人企业和国家政府部门从未停止过对太空和地外生命的探索领域。
公元2011年12月5日，美国航空航天局（nasa）宣布，该局通过开普勒太空望远镜项目证实了太阳系外第一颗类似地球的、可适合居住的行星。它也是迄今发现的最小且表面最可能存在液态水的行星。虽然开普勒-22b体积比地球大，大小约是地球的24倍，但它环绕的恒星在大小和温度方面都与太阳相当。
2070年，地球联合理事会召集全世界的航天专家，计划建立月球基地，期望通过对月球资源的开发缓解地球越加严峻的资源紧张问题。2085年，第一座月球基地成功建立，开始向地球不断输送资源。
公元2100年，随着地球气温的逐步升高，土地荒漠化越加严重，大量动植物死亡，农作物开始出现枯萎病。面对粮食减产，高温、土地荒漠等日益严峻的问题，地球上法制崩坏，暴乱频发，大部分宗教的信仰者开始认为一切都是神明对人类降下的责罚，纷纷建立了神庙供奉诸神，祈求得到诸神庇护，并与无神论的地球联合理事会展开长久的斗争，争夺地球为数不多的土地资源。
在各个派系的神话传说中，都有于大洪水相关的传说，华夏文明的上古传说中共工撞不周山、女娲补天，大禹治水；《旧约·创世纪》中所指的关于诺亚方舟的故事；希腊神话中的丢卡里翁与洪水；包括玛雅文明、北美印第安文明和苏美尔文明都有相关的传说记载，神庙的信徒们坚定地认为在不久的将来神明就会降下瘟疫与大洪水毁灭人类，而一定会有极少数的人类在神祇最虔诚的信徒的带领下度过灾难，找到神祇赐予的应许之地，重建人类文明。
地球联合理事会的科学家们经过分析计算，得到了一个让人绝望地结论，随着环境污染的日益严重，人口的急速爆炸以及资源的过度开采和利用，地球环境将不再适宜人类生存，随着气温的逐渐升高，两极冰川融化，地球终将被无尽汪洋淹没，人类将再无生存之地。
面对即将到来的末日，地球联合理事会和神庙经过谈判终止了无休止的战争，地球联合理事会和神庙秘密成立了存续院，旨在人类的存续和文明的传承，“拉撒路计划”开始秘密实施。拉撒路是《圣经·约翰福音》中记载的人物，他病危时没等到耶稣的救治就死了，但耶稣一口断定他将复活，四天后拉撒路果然从山洞里走出来。存续院的存在就是让即将面临毁灭的人类和文明找到复活之路。
总有人说科学的尽头是玄学，随着环境的日益恶劣，绝望的日益加深和越来越多当前科学无法解释的现象出现，许多科学家精神崩溃，最终选择相信神祇的存在，并遵循神的指引，加入了神庙的阵营。只有一少半科学家坚定地认为任何现象都能得到合理的科学解释，当前解释不了是因为人类当前的科技水平和认知还不够，只要人类的文明能够存续，科学能够继续发展，人类终究有一天能了解到所有一切的真相。大批信仰神明的科学家的加入使得神庙阵营的科技水平暴涨，成功反超了地球联合理事会，并利用为数不多的资源成功制造出了的无比强大的死亡机器人，渴求更多资源和权力的神庙高层撕毁停战协议，对地球联合理事会发动了毁灭性的战争。存续院也因大批的神庙阵营科学家撤离而分崩离析，“拉撒路计划”搁浅。
公元2145年，科技力量的增加帮助神庙在战争中取得了绝对优势地位，占据了更多的地球资源，为了人类的存续，神庙启动了“方舟计划”，开始筹备星际移民的工作。
公元2150年，神庙的第一批死亡机器人携带着数万人类受精卵和各类动物的冷冻胚胎乘坐“方舟号”宇宙飞船，开往开普勒-22b行星探索，一旦发现开普勒-22b行星事宜人类生存，就立即向地球发送信息，同时孵化胚胎，开辟殖民地，重建人类文明。神庙众人希望那里是众神赐予他们的应许之地。
公元2300年，由于科技水平的领先，神庙势力凭借着杀伤力巨大的死亡机器人继续蚕食地球联合理事会的势力，苟延残喘的地球联合理事会在一次战斗中侥幸俘获了两名第三代死亡机器人，篡改了它们的代码，并成功的复制了死亡机器人的技术，实现了批量生产，战争的局势开始扭转。于此同时，地球联合理事会得知了神庙的“方舟计划”已经实施，抢先开始了星际移民的计划，于是暗中启动了“蒲公英计划”，一旦确定开普勒-22b适宜人类生存，便同样向开普勒-22b移民，企图在更广阔的开普勒-22b上夺取一块属于无神论者的生存之地。
公元2700年，神庙接收到了“方舟号”从无比遥远的开普勒-22b上传回的信号，确认“开普勒-22b”上适宜人类生存。神庙高层欣喜万分，迅速开始了筛选星际移民的计划，重心也开始从战争向星际移民转移。而就在筛选的过程中，人性的贪婪和求生的本能暴露无疑，最终在神庙高层和贵族资本家乘坐“开拓号”飞船前往开普勒-22b后，自觉被遗弃的神庙信徒们发动了暴乱。地球联合理事会在漫长的战争中终于迎来了转机，他们成功研发出第十代死亡机器人，重整旗鼓的地球联合理事会与神庙展开了最后的战争。
公元2750年，第十代死亡机器人意外诞生了自我意识，拥有了独立意识的死亡机器人对长久奴役和控制他们的人类进行了毁灭般的打击，神庙和地球联合理事会的势力几近灭亡，只有少数人和存续院保留了下来，在地下堡垒和秘密基地中苟活，躲避空中死亡机器人的一遍遍搜索。长达数个纪元的战争消耗了大量的资源，也加速了环境的恶化和物种灭绝，使得本就满目疮痍的地球更是面目全非，
公元2826年，此时的地球已经被无尽的汪洋淹没，只有少数的几座孤岛存在，成为了名副其实的蔚蓝色星球。一切都被深埋海底，人类几近灭绝，。幸存的人类已经有少数开始进化出了鳃和蹼，向两栖生物方向进化。作为地球上残存人类心中的圣地——珠穆朗玛峰，曾经地球上最高的山峰，如今已经成为一座孤岛，存续院最后的秘密基地就设立在此。利用仅剩的资源，制造了“伏羲”、“女娲”、“亚当”“夏娃”四台液态金属机器人。计划由“伏羲”和“女娲”携带十六个人类冷冻胚胎、存续院六名工作人员的电子记忆数据、以及存续院保存的全部知识数据，乘坐仅剩的“希望号”飞船，开往开普勒-22b，希望能重延续地球联合理事会的唯物主义文明。留下的工作人员则进入冷冻舱陷入沉眠，“亚当”和“夏娃”负责守护休眠的工作人员和冷冻胚胎，期待在环境重新适宜人类生存后，重建人类文明。